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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Treinta y Tres. |
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Fecha : |
17/04/2017 |
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Actualizado : |
11/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
LAKIN, S.M.; DEAN, C.; NOYES, N.R.; DETTENWANGER, A.; ROSS, A. S.; DOSTER, E.; ROVIRA, P.J.; ABDO, Z.; JONES, K.L.; RUIZ, J.; BELK, K.E.; MORLEY, P.S.; BOUCHER, C. |
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Afiliación : |
STEVEN M. LAKIN; CHRIS DEAN; NOELLE R. NOYES; ADAM DETTENWANGER; ANNE SPENCER ROSS; ENRIQUE DOSTER; PABLO JUAN ROVIRA SANZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. Department of Animal Sciences, Colorado State University, USA.; ZAID ABDO; KENNETH L. JONES; JAIME RUIZ; KEITH E. BELK; PAUL S. MORLEY; CHRISTINA BOUCHER. |
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Título : |
MEGARes: an antimicrobial resistance database for high throughput sequencing. |
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Fecha de publicación : |
2017 |
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Fuente / Imprenta : |
Nucleic Acids Research, 2017 v.45 p.574-580. |
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DOI : |
10.1093/nar/gkw1009 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article History: Published online 2016 Nov 24.
DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkw1009 |
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Contenido : |
Antimicrobial resistance has become an imminent concern for public health. As methods for detection and characterization of antimicrobial resistance move from targeted culture and polymerase chain reaction to high throughput metagenomics, appropriate resources for the analysis of large-scale data are required. Currently, antimicrobial resistance databases are tailored to smaller-scale, functional profiling of genes using highly descriptive annotations. Such characteristics do not facilitate the analysis of large-scale, ecological sequence datasets such as those produced with the use of metagenomics for surveillance. In order to overcome these limitations, we present MEGARes (https://megares.meglab.org), a hand-curated antimicrobial resistance database and annotation structure that provides a foundation for the development of high throughput acyclical classifiers and hierarchical statistical analysis of big data. MEGARes can be browsed as a stand-alone resource through the website or can be easily integrated into sequence analysis pipelines through download. Also via the website, we provide documentation for AmrPlusPlus, a user-friendly Galaxy pipeline for the analysis of high throughput sequencing data that is pre-packaged for use with the MEGARes database. |
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Palabras claves : |
BASE DE DATOS; BIOINFORMÁTICA; DATASETS; DRUG RESISTANCE; GENES; METAGENÓMICA; METAGENOMICS; MICROBIAL; POLYMERASE CHAIN REACTION; PUBLIC HEALTH MEDICINE; RESISTENCIA ANTIMICROBIANA; SEQUENCE ANALYSIS. |
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Asunto categoría : |
L01 Ganadería |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/6677/1/Rovira-arb-2017-1.pdf
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210519/
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Treinta y Tres (TT) |
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Biblioteca
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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Fecha actual : |
21/02/2014 |
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Actualizado : |
17/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Agropecuarias |
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Autor : |
BENNADJI, Z.; ALONSO, R.; CASTRO, M.; CIGANDA, V.; GOÑI, C.; PÉREZ DE VIDA, F.; VÁZQUEZ, D.; BERGER, A.; GASO, D.; CERETTA, S.; FASSIO, A.; SALDAIN, N.E.; OTERO, A. |
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Afiliación : |
ZOHRA BENNADJI SOUALHIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARIA DEL ROSARIO ALONSO DE SOUZA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; MARINA CASTRO DERENYI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; VERONICA SOLANGE CIGANDA BRASCA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CARMEN TERESITA GOÑI ALTUNA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BLAS PEREZ DE VIDA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DANIEL VÁZQUEZ PEYRONEL, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANDRES GUSTAVO BERGER RICCA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DEBORAH VIVIANA GASO MELGAR, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SERGIO EDUARDO CERETTA SORIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ALBERTO SANTIAGO FASSIO ARAUJO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; NÉSTOR ELIO SALDAIN CROCCE, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ALVARO RICARDO OTERO CAMA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Mejoramiento genético más ecofisiología: generando espacios interdisciplinarios para la disminución de la vulnerabilidad al cambio climático |
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Fecha de publicación : |
2011 |
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Fuente / Imprenta : |
Revista INIA Uruguay, 2011, no. 25 p. 43-48 |
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Serie : |
(Revista INIA; 25) |
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ISSN : |
1510-9011 |
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Idioma : |
Español |
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Thesagro : |
CAMBIO CLIMATICO; FITOMEJORAMIENTO; MEJORA GENETICA; SISTEMAS DE PRODUCCIÓN; SOSTENIBILIDAD. |
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Asunto categoría : |
K01 Ciencias forestales - Aspectos generales |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/6980/1/18429130112144824.pdf
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Marc : |
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700 1 $aOTERO, A.
773 $tRevista INIA Uruguay, 2011, no. 25 p. 43-48
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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